辦公室主要職能：負(fù)責(zé)機(jī)關(guān)日常運(yùn)轉(zhuǎn)，承擔(dān)安全、保密、信訪、政務(wù)公開(kāi)和國(guó)際合作交流等工作。承擔(dān)局黨組、局領(lǐng)導(dǎo)交辦的其他事項(xiàng)。

規(guī)劃財(cái)務(wù)和法規(guī)司主要職能：組織擬訂醫(yī)療保障工作規(guī)劃。承擔(dān)機(jī)關(guān)和直屬單位預(yù)決算等工作，推進(jìn)醫(yī)療保障信息化建設(shè)。組織起草法律法規(guī)草案、規(guī)章和標(biāo)準(zhǔn)，承擔(dān)規(guī)范性文件的合法性審核工作，承擔(dān)行政復(fù)議、行政應(yīng)訴等工作。承擔(dān)局黨組、局領(lǐng)導(dǎo)交辦的其他事項(xiàng)。

待遇保障司主要職能：擬訂醫(yī)療保障籌資和待遇政策，統(tǒng)籌城鄉(xiāng)醫(yī)療保障待遇標(biāo)準(zhǔn)。統(tǒng)籌推進(jìn)多層次醫(yī)療保障體系建設(shè)。建立健全醫(yī)療保障關(guān)系轉(zhuǎn)移接續(xù)制度。組織擬訂長(zhǎng)期護(hù)理保險(xiǎn)制度改革方案并組織實(shí)施。承擔(dān)局黨組、局領(lǐng)導(dǎo)交辦的其他事項(xiàng)。

醫(yī)藥服務(wù)管理司主要職能：擬訂醫(yī)保目錄和支付標(biāo)準(zhǔn)，建立動(dòng)態(tài)調(diào)整機(jī)制，制定醫(yī)保目錄準(zhǔn)入談判規(guī)則并組織實(shí)施。擬訂定點(diǎn)醫(yī)藥機(jī)構(gòu)醫(yī)保協(xié)議和支付管理、異地就醫(yī)管理辦法和結(jié)算政策。組織推進(jìn)醫(yī)保支付方式改革。組織開(kāi)展藥品、醫(yī)用耗材、醫(yī)療技術(shù)的經(jīng)濟(jì)性評(píng)價(jià)。承擔(dān)局黨組、局領(lǐng)導(dǎo)交辦的其他事項(xiàng)。

醫(yī)藥價(jià)格和招標(biāo)采購(gòu)司主要職能：擬訂藥品、醫(yī)用耗材價(jià)格和醫(yī)療服務(wù)項(xiàng)目、醫(yī)療服務(wù)設(shè)施收費(fèi)等政策并組織實(shí)施，建立價(jià)格信息監(jiān)測(cè)和發(fā)布制度。擬訂藥品、醫(yī)用耗材的招標(biāo)采購(gòu)、配送及結(jié)算管理政策并監(jiān)督實(shí)施，推進(jìn)招標(biāo)采購(gòu)平臺(tái)建設(shè)。承擔(dān)局黨組、局領(lǐng)導(dǎo)交辦的其他事項(xiàng)。

基金監(jiān)管司主要職能：擬訂醫(yī)療保障基金監(jiān)督管理辦法并組織實(shí)施。建立健全醫(yī)療保障基金安全防控機(jī)制，建立健全醫(yī)療保障信用評(píng)價(jià)體系和信息披露制度。監(jiān)督管理納入醫(yī)保支付范圍的醫(yī)療服務(wù)行為和醫(yī)療費(fèi)用，規(guī)范醫(yī)保經(jīng)辦業(yè)務(wù)，依法查處醫(yī)療保障領(lǐng)域違法違規(guī)行為。承擔(dān)局黨組、局領(lǐng)導(dǎo)交辦的其他事項(xiàng)。

機(jī)關(guān)黨委（人事司）主要職能：負(fù)責(zé)機(jī)關(guān)和在京直屬單位的黨群工作。承擔(dān)機(jī)關(guān)和直屬單位的人事管理、機(jī)構(gòu)編制、教育培訓(xùn)、隊(duì)伍建設(shè)等工作。承擔(dān)局黨組、局領(lǐng)導(dǎo)交辦的其他事項(xiàng)。